Se la portata del filtro non diminuisce puoi anche aspettare, piano piano si dovrebbero decomporre, se ci sono delle lumachine in acquario in genere ci pensano loro.
Altrimenti se hai delle pinze per acquario anche di plastica puoi toglierle o sifonare solo in quel punto il minimo indispensabile, calcolando che ovviamente poi dovrai reimmettere l'acqua che hai tolto, alla stessa temperatura, quindi preparatela il giorno prima.
La lana di perlon puoi provare a lavarla in una bacinella con un pò di acqua dell'acquario o della demineralizzata, insomma in acqua non clorata, in questo modo non perdi batteri, ma il grosso dei batteri si annidano nei siporax, quindi puoi cambiarla tranquillamente se vuoi.
Non capisco in che senso però dici che i siporax sono sotto il filtro
