Si, ne tiene conto: la CO2 erogata artificialmente abbassa il pH; nel tuo caso il pH è più alto di quello che dovrebbe esserci per avere una buona concentrazione di CO2 in acqua (intorno ai 25 mg/l).
Qui diciamo che il messaggio del tool è un po' forzato: ci sono acquari senza erogazione artificiale che funzionano ugualmente bene, senza esplosioni algali. Basta adeguare anche nutrienti e luce (riducendoli), le piante cresceranno solo più lentamente, un po' meno rigogliose.
Non lo fa per la CO2.
Fermo restando che come ha scritto Fablav le filamentose non sono un grosso problema, visto che siamo in chimica proviamo a capire perché il pH è ancora ad 8 nonostante le 20 bolle al minuto.
In attesa delle foto, mi viene il dubbio che ci sia qualche materiale calcareo in vasca (che non fa scendere il pH verso valori acidi, e tende a far aumentare KH e GH). Hai provato a testare fondo, rocce, pietre ecc con un po' di acido muriatico?
