Buongiorno, ho da poco acquistato due apistogramma MacMasteri maschi messi in acquario in tempi diversi.
Uno di loro, penso il veterano, lo insegue per tutta la vasca e a volte lo becca. 
Mi sapete dare qualche consiglio? Grazie

Sono ciclidi, e i maschi sono come noto molto territoriali.
Se la vasca non offre nascondigli/spezzavista sufficienti è normale questo comportamento. A lungo andare il "sottomesso" potrebbe ucciso o morire di stress.
 
Ma poi scusa perché hai messo due maschi? Femmine ne hai?

Ho una mezza noce di cocco e qualche foglia di catappa . No non ho femmine…

Aggiunto dopo 11 minuti 34 secondi:
Sarebbe utile mettere 2 femmine per non farli beccare?

Io metterei solo una coppia 

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Quoto Pietro, una coppia. Togli un maschio e metti una femmina. E non è questione del numero di femmine (tra l'altro alcuni apistogramma hanno tendenze haremiche) ma di territorio, puoi avere 10 femmine ma il dominante scaccerá sempre l'altro se ritiene che sia all'interno del suo spazio.

Quoto entrambi, la vasca è troppo piccola per due maschi.

Aggiunto dopo 1 minuto 13 secondi:
In più li hai messi in tempi diversi, il primo ovviamente ha visto nel secondo un intruso. 

Sposto in ciclidi nani.